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走近生物信息学:《坏血》里除了谎言,有没有真诚的理想?

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「无论是糖尿病还是癌症,只需从手指尖取几滴血,就能在半小时以内得到诊断结果。」这是血液检验公司Theranos的创始人——伊丽莎白·霍尔姆斯在2003年就勾勒出的美好图景。理想尚未启程,就有无数风投资金趋之若鹜,并赢得默多克、基辛格这样明星董事的背书。他们都相信Theranos将成为医学领域的苹果,而霍尔姆斯就是下一个改变世界的乔布斯。2014年,Theranos市值达到90亿美元。
然而一切都在2015年急转直下,Theranos的血液检测仪被爆造假:当初承诺的「一滴血检测上百项身体指标」,只有12项真正由Theranos自家产品完成;而在这仅有的12项里,检测结果几乎无一准确。一瞬间,霍尔姆斯跌落神坛,不仅面临从业禁令,并背上了多项欺诈指控。
每一个见过霍尔姆斯的人,都无法忘记她那蓝如深海的大眼睛、凝视人的方式还有低沉的嗓音,而如今都被认为是她骗取信任的“利器”;Theranos所谓的“最伟大创新”也不过是一项古老的伎俩——撒谎。但这惊天骗局的背后,难道就没有一份真诚和一丝可行性?“滴血成金”的神话看似遥遥无期,那其他生物技术是否具有一举揪出疾病苗头的潜力?
本期嘉宾宋东源是加州大学洛杉矶分校生物信息学的在读博士,他的研究比血液样本更进一步,通过对单细胞的RNA测序,并借助计算机和统计学方法,一探细胞间差异,以此揭开疾病和衰老的奥秘。
斜杠青年
宋东源 - 加州大学洛杉矶分校生物信息学博士在读/学术男/博物控
“热爱自然的生物信息学研究者”
个人主页:http://jsb.ucla.edu/people/dongyuan-song
特派观察员
歆歆 - 程序媛/「斜杠青年研究所」主播
“对东源的第一印象是——生物课随堂检测小达人”
敲黑板划重点
[04:45] 什么是生物信息学(Bioinformatics)?
“通过计算机对(DNA/RNA序列、蛋白质结构、生物图像等)生物数据进行建模、分析和可视化”
[08:29] “湿实验”和“干实验”有什么区别?
[10:00] 如何避免论文想法与其他学者撞车?
[11:59] 市面上的基因检测靠谱吗?
[13:47] “一滴血检测所有病”:空中楼阁还是指日可待?
[18:17] 单细胞RNA测序的机遇与挑战
[23:47] 基因数目浩如海,“关键”者占比几何?
[28:39] 生物信息学领域正在进行的重要计算
[33:45] 搞学术也要“追热点”
[35:09] 大有可为的人工合成淀粉技术
声音素材
Einaudi - Passaggio (Arr. for Two Cellos)
Agnes Obel - Under Giant Trees
The Inventor: Out for Blood in Silicon Valley (2019) - Official Trailer
Jean-Baptiste Barrière - 6 Cello Sonatas:No. 4 in G Major: I. Andante
互动话题
Q:你有什么自豪或不满意的身体特征(单双眼皮、直发卷发、有无酒窝…)?
期待在评论区里见到你的回答!如果你对本期嘉宾和话题还有其他好奇,欢迎你在评论区留下你的问题,本研究所帮你“炮轰”他/她!
提到的书
《坏血:一个硅谷巨头的秘密与谎言》 [美]约翰·卡雷鲁 (Bad Blood: Secrets and Lies in a Silicon Valley Startup)
生物学辞典
1. 中心法则:DNA序列被转录为RNA,RNA序列被翻译为蛋白质,蛋白质反过来协助前两项流程,并协助DNA的自我复制。
2. 基因测序:从血液或唾液中测定分析基因全序列,从而预测个体的行为特征与行为合理性,以及罹患多种疾病的可能性。
3. Q: 为何要进行单细胞测序?
A: 传统的研究方法是在多细胞水平进行的,最终得到的信号值其实是多个细胞的平均。而单细胞测序能够检出混杂样品测序所无法得到的异质性信息,这将带领整个遗传学领域进入新的次元。
详见:单细胞测序扫盲:是什么?为什么?怎么做? https://zhuanlan.zhihu.com/p/28844468

4. 科技日报:我科学家在国际上首次实现人工合成淀粉 http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2021-09/24/content_522495.htm?div=-1

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收听方式:小宇宙App/喜马拉雅FM/网易云音乐/QQ音乐/虎嗅/汽水儿/Apple Podcasts/Spotify
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「斜杠青年研究所」是一档分享酷炫爱好/奇葩副业/独特经历的播客节目,我们会在每期邀请一位具有多重职业/多元身份/多姿生活的斜杠青年,畅谈他们的奇幻探险。愿嘉宾的故事能为你带来灵感与勇气,伴你解锁你人生的第N种可能。
联系邮箱:xiegangqn@outlook.com 期待与你的互动:)

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然而一切都在2015年急转直下,Theranos的血液检测仪被爆造假:当初承诺的「一滴血检测上百项身体指标」,只有12项真正由Theranos自家产品完成;而在这仅有的12项里,检测结果几乎无一准确。一瞬间,霍尔姆斯跌落神坛,不仅面临从业禁令,并背上了多项欺诈指控。
每一个见过霍尔姆斯的人,都无法忘记她那蓝如深海的大眼睛、凝视人的方式还有低沉的嗓音,而如今都被认为是她骗取信任的“利器”;Theranos所谓的“最伟大创新”也不过是一项古老的伎俩——撒谎。但这惊天骗局的背后,难道就没有一份真诚和一丝可行性?“滴血成金”的神话看似遥遥无期,那其他生物技术是否具有一举揪出疾病苗头的潜力?
本期嘉宾宋东源是加州大学洛杉矶分校生物信息学的在读博士,他的研究比血液样本更进一步,通过对单细胞的RNA测序,并借助计算机和统计学方法,一探细胞间差异,以此揭开疾病和衰老的奥秘。
斜杠青年
宋东源 - 加州大学洛杉矶分校生物信息学博士在读/学术男/博物控
“热爱自然的生物信息学研究者”
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特派观察员
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“对东源的第一印象是——生物课随堂检测小达人”
敲黑板划重点
[04:45] 什么是生物信息学(Bioinformatics)?
“通过计算机对(DNA/RNA序列、蛋白质结构、生物图像等)生物数据进行建模、分析和可视化”
[08:29] “湿实验”和“干实验”有什么区别?
[10:00] 如何避免论文想法与其他学者撞车?
[11:59] 市面上的基因检测靠谱吗?
[13:47] “一滴血检测所有病”:空中楼阁还是指日可待?
[18:17] 单细胞RNA测序的机遇与挑战
[23:47] 基因数目浩如海,“关键”者占比几何?
[28:39] 生物信息学领域正在进行的重要计算
[33:45] 搞学术也要“追热点”
[35:09] 大有可为的人工合成淀粉技术
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《坏血:一个硅谷巨头的秘密与谎言》 [美]约翰·卡雷鲁 (Bad Blood: Secrets and Lies in a Silicon Valley Startup)
生物学辞典
1. 中心法则:DNA序列被转录为RNA,RNA序列被翻译为蛋白质,蛋白质反过来协助前两项流程,并协助DNA的自我复制。
2. 基因测序:从血液或唾液中测定分析基因全序列,从而预测个体的行为特征与行为合理性,以及罹患多种疾病的可能性。
3. Q: 为何要进行单细胞测序?
A: 传统的研究方法是在多细胞水平进行的,最终得到的信号值其实是多个细胞的平均。而单细胞测序能够检出混杂样品测序所无法得到的异质性信息,这将带领整个遗传学领域进入新的次元。
详见:单细胞测序扫盲:是什么?为什么?怎么做? https://zhuanlan.zhihu.com/p/28844468

4. 科技日报:我科学家在国际上首次实现人工合成淀粉 http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2021-09/24/content_522495.htm?div=-1

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